Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms