Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms