Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms