Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms