Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbtb39Q6PDK0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms