Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Krt40Q6IFX3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Krt40Q6IFX3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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