Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Msl2Q69ZF8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Msl2Q69ZF8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Msl2Q69ZF8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Msl2Q69ZF8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Msl2Q69ZF8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Msl2Q69ZF8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Msl2Q69ZF8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Msl2Q69ZF8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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