Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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Ccdc18Q640L5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Ccdc18Q640L5 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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Ccdc18Q640L5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Ccdc18Q640L5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Ccdc18Q640L5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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Ccdc18Q640L5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc18Q640L5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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