Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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