Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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SnrpcQ62241 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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SnrpcQ62241 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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SnrpcQ62241 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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SnrpcQ62241 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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SnrpcQ62241 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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SnrpcQ62241 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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SnrpcQ62241 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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SnrpcQ62241 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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SnrpcQ62241 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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SnrpcQ62241 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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SnrpcQ62241 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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SnrpcQ62241 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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SnrpcQ62241 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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