Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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