Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Foxd1Q61345 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Foxd1Q61345 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd1Q61345 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.3 ms