Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms