Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Neurod1Q60867 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms