Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Traf3Q60803 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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