Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3aQ60520 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3aQ60520 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3aQ60520 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms