Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms