Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ecm2Q5FW85 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms