Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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