Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms