Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms