Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc185Q3V118 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms