Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms