Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms