Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KhsrpQ3U0V1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms