Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Hbq1bQ3U0A6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hbq1bQ3U0A6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hbq1bQ3U0A6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms