Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy4Q3TYX8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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