Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

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Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col24a1Q30D77 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col24a1Q30D77 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col24a1Q30D77 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col24a1Q30D77 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col24a1Q30D77 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col24a1Q30D77 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col24a1Q30D77 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col24a1Q30D77 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col24a1Q30D77 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col24a1Q30D77 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col24a1Q30D77 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col24a1Q30D77 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col24a1Q30D77 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col24a1Q30D77 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col24a1Q30D77 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col24a1Q30D77 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col24a1Q30D77 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms