Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms