Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam171bQ14CH0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms