Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms