Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms