Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Traf3ip1Q149C2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms