Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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