Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam83bQ0VBM2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms