Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms