Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms