Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm21064-201ENSMUST00000189723 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Krtap13-201ENSMUST00000053149 882 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms