Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms