Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms