Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GscQ02591 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GscQ02591 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms