Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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