Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms