Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms