Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SmsP97355 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SmsP97355 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SmsP97355 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SmsP97355 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SmsP97355 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SmsP97355 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SmsP97355 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SmsP97355 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SmsP97355 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SmsP97355 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SmsP97355 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms