Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms