Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Irx1P81068 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Irx1P81068 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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