Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps3P62908 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps3P62908 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms