Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rab3cP62823 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab3cP62823 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms