Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia3P60469 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms